合同纠纷调解的部门：
第一、行政调解，调解的部门是双方当事人的上级业务主管部门。
第二、仲裁调解，调解的部门是仲裁机构。
第三、调解，调解部门是。
法律依据：《民事诉讼法》第九条规定 人民审理民事案件，应当根据自愿和合法的原则进行调解;调解不成的，应当及时判决。
《中华人民共和国人民调解法》第二条规定 本法所称人民调解，是指人民调解委员会通过说服、疏导等方法，促使当事人在平等协商基础上自愿达成调解协议，解决民间纠纷的活动。
《中华人民共和国仲裁法》第二条规定 平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。